Peptide thâm nhập tế bào là những peptide nhỏ có thể dễ dàng xuyên qua màng tế bào.Loại phân tử này, đặc biệt là CPP có chức năng nhắm mục tiêu, hứa hẹn mang lại khả năng vận chuyển thuốc hiệu quả đến các tế bào đích.
Vì vậy, việc nghiên cứu về nó có ý nghĩa y sinh nhất định.Trong nghiên cứu này, các CPP có hoạt tính xuyên màng khác nhau được nghiên cứu ở cấp độ trình tự, cố gắng tìm ra các yếu tố ảnh hưởng đến hoạt động xuyên màng của CPP, sự khác biệt về trình tự giữa CPP có hoạt động khác nhau và NonCPP, đồng thời đưa ra phương pháp phân tích trình tự sinh học.
Các trình tự CPP và NonCPP được lấy từ cơ sở dữ liệu CPPsite và các tài liệu khác nhau, đồng thời các peptide xuyên màng (HCPP, MCPP, LCPP) có hoạt tính xuyên màng cao, trung bình và thấp được trích xuất từ các trình tự CPP để xây dựng các bộ dữ liệu.Dựa trên các bộ dữ liệu này, các nghiên cứu sau đã được thực hiện:
1, Thành phần axit amin và cấu trúc thứ cấp của các CPP và NonCPP hoạt động khác nhau đã được phân tích bằng ANOVA.Người ta nhận thấy rằng tương tác tĩnh điện và kỵ nước của các axit amin đóng vai trò quan trọng trong hoạt động xuyên màng của CPP, đồng thời cấu trúc xoắn ốc và cuộn ngẫu nhiên cũng ảnh hưởng đến hoạt động xuyên màng của CPP.
2. Các tính chất vật lý, hóa học và độ dài của CPP với các hoạt động khác nhau được hiển thị trên mặt phẳng hai chiều.Người ta nhận thấy rằng CPP và NonCPP với các hoạt động khác nhau có thể được nhóm lại theo một số thuộc tính đặc biệt và HCPP, MCPP, LCPP và NonCPP được chia thành ba cụm, cho thấy sự khác biệt của chúng;
3. Trong bài báo này, khái niệm trọng tâm vật lý và hóa học của trình tự sinh học được đưa ra, các phần dư tạo nên trình tự được coi là các điểm hạt và trình tự được trừu tượng hóa thành một hệ thống hạt để nghiên cứu.Phương pháp này được áp dụng để phân tích CPP bằng cách chiếu các CPP có hoạt động khác nhau lên mặt phẳng 3D bằng phương pháp PCA và người ta nhận thấy rằng hầu hết các CPP được nhóm lại với nhau và một số LCPP được nhóm lại với nhau bằng NonCPP.
Nghiên cứu này có ý nghĩa đối với việc thiết kế CPP và tìm hiểu sự khác biệt trong trình tự của CPP với các hoạt động khác nhau.Ngoài ra, phương pháp phân tích trọng tâm vật lý và hóa học của các trình tự sinh học được giới thiệu trong bài báo cũng có thể được sử dụng để phân tích các vấn đề sinh học khác.Đồng thời, chúng có thể được sử dụng làm tham số đầu vào cho một số bài toán phân loại sinh học và đóng vai trò trong việc nhận dạng mẫu.
Thời gian đăng: 15-06-2023